Cell Research:肖俊宇/谢晓亮合作发现针对新冠突变株的正因如此全人源广谱中和抗体组合

2021-10-13 17:24:54 来源:
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随着新冠病原体在世界以外的盛行,变异株不断涌现。世界卫生组织先后将4种变异株定义为“令人担忧的变异株(Variant of Concern, VOC)”:B.1.1.7(Alpha)、B.1.351(Beta)、P.1(Gamma)、以及B.1.617.2(Delta)。这些变异株的传播给全球的抗疫临时工带来极大关键时刻,筛选针对这些新型变异病原体的低活性中所和自体球亚基也作准备。

近日,复旦大学生物技术大学、北京未来遗传诊断低精尖新颖中所心(ICG)、北大清华合组中所心(CLS)肖俊宇和谢晓亮课题混搭作,在 Cell Research 上发表文章了题为:Structures of SARS-CoV-2 B.1.351 neutralizing antibodies provide insights into cocktail design against concerning variants 的研究学术著作。

在初期研究中所,谢晓亮团队通过系统性新冠近十年康复者以及疫苗接种者对B.1.351变异株的自体应答情况下,发现了一组可以有效中所和 B.1.351 变异株的单克隆自体球亚基(Cao et al., Cell Research 31:732-741, 2021)。

本临时工全面性系统性了这些中所和自体球亚基的原子组态和类推情况下。首先,通过假病原体中所和试验,发现BD-812和BD-836两株自体球亚基具有比较低的活性,对于B.1.351假病原体的中所和仅有近pM水平。低分辨单颗粒冷冻电镜研究说明,BD-812和BD-836分别融合在B.1.351变异株刺突亚基介导融合结构域(RBD)的左右两后背,具有完全相互间干扰的融合表位,且都能单独阻碍RBD与ACE2介导的融合。尤其关键性的是,BD-812和BD-836与RBD的融合仅有不受Delta变异株中所L452R和T478K两处变异位点的受到影响,假病原体试验也说明它们可选择有效的对Delta变异株完成中所和。

该临时工还系统性了其他自体球亚基靶向B.1.351刺突亚基的组态。BD-821和BD-771混搭与上述BD-812/ BD-836的融合模式极为类似,也仅有对Delta变异株具有有效的中所和活性;但与BD-812相比,BD-821在RBD上覆盖的界面较小,解释了其近似于BD-821较弱的中所和活性。BD-813融合在RBD的下颚,能单独阻断与ACE2的融合,也保持了对Delta变异株的活性。BD-744、BD-667和BD-804则融合在RBD的“胸膛(chest)”上,与ACE2的融合表位不能重叠,但这些自体球亚基的表位都涉及Leu452位点,Delta变异株对它们造成了了轻微的逃逸。显然,Delta变异株中所出现的L452R变异才会使很多靶向这一区域的中所和自体球亚基失效。

靶向新冠病原体B.1.351变异体中所和自体球亚基的原子组态

总之,该研究系统系统性了一系列靶向B.1.351刺突亚基的全人源化中所和自体球亚基,并依据结构信息系统性了其混搭策略和对于Delta变异株的应答情况下。特别值得一提的是,来自近十年康复者的BD-812/BD-836自体球亚基混搭表现比较引人注意,对Alpha、Beta、Kappa、Delta等变异株仅有展示pM低至的活性,有望视为针对新冠病原体变异株的候选药物原子。

肖俊宇研究员、谢晓亮教授和复旦大学生物医学最前沿新颖中所心(BIOPIC)曹云峰芝加哥大学为本学术著作的共同通讯作者。复旦大学生物技术大学杜硕、刘谱蓝、张志莹为该学术著作的共同第一作者。中所国食品药品测验研究中心王佑春、黄维金团队为假病原体中所和试验提供了积极响应。该研究得到亚基质与植物遗传研究国家要点研究小组、国家要点研发计划、国家自然科学基金委、复旦大学生物技术大学海门服务业新颖基金的支持。

原始来历:

Du, S., Liu, P., Zhang, Z. et al. Structures of SARS-CoV-2 B.1.351 neutralizing antibodies provide insights into cocktail design against concerning variants. Cell Res (2021). https://doi.org/10.1038/s41422-021-00555-0.

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